MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012943	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012943	CGT	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
3	NC_012943	CAC	2	6	129	134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
4	NC_012943	GTC	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
5	NC_012943	GAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
6	NC_012943	CAG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
7	NC_012943	TCG	2	6	269	274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
8	NC_012943	AGC	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
9	NC_012943	GCC	2	6	362	367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
10	NC_012943	CCG	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
11	NC_012943	CGAC	2	8	413	420	25 %	0 %	25 %	50 %	253796916
12	NC_012943	CGA	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
13	NC_012943	GCC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
14	NC_012943	ACG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
15	NC_012943	TGA	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796916
16	NC_012943	CGTT	2	8	629	636	0 %	50 %	25 %	25 %	253796916
17	NC_012943	CGC	3	9	663	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
18	NC_012943	CCCG	2	8	691	698	0 %	0 %	25 %	75 %	253796916
19	NC_012943	AC	3	6	745	750	50 %	0 %	0 %	50 %	253796916
20	NC_012943	GGCA	2	8	762	769	25 %	0 %	50 %	25 %	253796916
21	NC_012943	GTT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796916
22	NC_012943	CGA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
23	NC_012943	TTC	2	6	958	963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796916
24	NC_012943	CAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796916
25	NC_012943	TCATC	2	10	1004	1013	20 %	40 %	0 %	40 %	253796916
26	NC_012943	CCCA	2	8	1020	1027	25 %	0 %	0 %	75 %	253796916
27	NC_012943	AGC	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
28	NC_012943	ACC	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
29	NC_012943	CGA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
30	NC_012943	CAG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
31	NC_012943	GC	3	6	1223	1228	0 %	0 %	50 %	50 %	253796916
32	NC_012943	GCG	2	6	1339	1344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796916
33	NC_012943	CCG	2	6	1361	1366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
34	NC_012943	CA	3	6	1510	1515	50 %	0 %	0 %	50 %	253796916
35	NC_012943	CAC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
36	NC_012943	TTC	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012943	A	7	7	1655	1661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012943	TC	4	8	1664	1671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012943	CGG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012943	AC	4	8	1788	1795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012943	CCGA	2	8	1827	1834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012943	TCG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012943	ACC	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012943	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012943	ATG	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012943	GTT	3	9	2027	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012943	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012943	CGT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012943	TCG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012943	CGTTT	2	10	2194	2203	0 %	60 %	20 %	20 %	253796917
51	NC_012943	GTGG	2	8	2234	2241	0 %	25 %	75 %	0 %	253796917
52	NC_012943	GCCA	2	8	2252	2259	25 %	0 %	25 %	50 %	253796917
53	NC_012943	CGGTGC	2	12	2266	2277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253796917
54	NC_012943	GTT	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
55	NC_012943	CCG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
56	NC_012943	TTG	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
57	NC_012943	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
58	NC_012943	TTG	2	6	2565	2570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
59	NC_012943	ATT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253796917
60	NC_012943	TCAG	2	8	2596	2603	25 %	25 %	25 %	25 %	253796917
61	NC_012943	CGC	2	6	2612	2617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
62	NC_012943	GAC	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
63	NC_012943	GGT	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796917
64	NC_012943	CGT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796917
65	NC_012943	GCC	2	6	2793	2798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
66	NC_012943	CGG	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796917
67	NC_012943	CGTT	2	8	2822	2829	0 %	50 %	25 %	25 %	253796917
68	NC_012943	GCA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
69	NC_012943	CTT	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796917
70	NC_012943	AC	3	6	2957	2962	50 %	0 %	0 %	50 %	253796917
71	NC_012943	CCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796917
72	NC_012943	GC	3	6	3034	3039	0 %	0 %	50 %	50 %	253796917
73	NC_012943	GAT	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796917
74	NC_012943	TTG	3	9	3118	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
75	NC_012943	ACGG	2	8	3174	3181	25 %	0 %	50 %	25 %	253796917
76	NC_012943	GCCT	2	8	3236	3243	0 %	25 %	25 %	50 %	253796917
77	NC_012943	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796917
78	NC_012943	CGGTT	2	10	3343	3352	0 %	40 %	40 %	20 %	253796917
79	NC_012943	CGTC	2	8	3387	3394	0 %	25 %	25 %	50 %	253796918
80	NC_012943	TTG	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
81	NC_012943	CGA	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
82	NC_012943	GGTA	2	8	3567	3574	25 %	25 %	50 %	0 %	253796918
83	NC_012943	GTG	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
84	NC_012943	ACG	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
85	NC_012943	CAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796918
86	NC_012943	ATC	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796918
87	NC_012943	TGT	2	6	3725	3730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
88	NC_012943	GGTT	2	8	3749	3756	0 %	50 %	50 %	0 %	253796918
89	NC_012943	CGG	2	6	3775	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
90	NC_012943	GAT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796918
91	NC_012943	GT	3	6	3914	3919	0 %	50 %	50 %	0 %	253796918
92	NC_012943	TGG	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
93	NC_012943	CCGC	2	8	3977	3984	0 %	0 %	25 %	75 %	253796918
94	NC_012943	GAA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796918
95	NC_012943	AGC	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
96	NC_012943	GGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
97	NC_012943	GGC	2	6	4155	4160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
98	NC_012943	GAC	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
99	NC_012943	GGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
100	NC_012943	TGG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
101	NC_012943	GTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
102	NC_012943	CGA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
103	NC_012943	CGG	2	6	4403	4408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
104	NC_012943	CCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796918
105	NC_012943	CCG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796918
106	NC_012943	GGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
107	NC_012943	TGC	3	9	4634	4642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796919
108	NC_012943	CG	5	10	4644	4653	0 %	0 %	50 %	50 %	253796919
109	NC_012943	GTCGG	2	10	4691	4700	0 %	20 %	60 %	20 %	253796919
110	NC_012943	CGA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796919
111	NC_012943	GGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796919
112	NC_012943	CCA	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796919
113	NC_012943	ACG	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796919
114	NC_012943	CGC	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796919
115	NC_012943	CGG	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796919
116	NC_012943	CG	3	6	5080	5085	0 %	0 %	50 %	50 %	253796919
117	NC_012943	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012943	AGA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
119	NC_012943	GTG	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
120	NC_012943	GCG	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
121	NC_012943	GAG	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796920
122	NC_012943	AAG	2	6	5357	5362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
123	NC_012943	GGT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
124	NC_012943	CGA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
125	NC_012943	TGC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796920
126	NC_012943	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
127	NC_012943	CCAC	2	8	5601	5608	25 %	0 %	0 %	75 %	253796920
128	NC_012943	ACCG	2	8	5620	5627	25 %	0 %	25 %	50 %	253796920
129	NC_012943	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
130	NC_012943	CGG	2	6	5656	5661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
131	NC_012943	TGG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
132	NC_012943	CGGCGT	2	12	5704	5715	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253796920
133	NC_012943	GGT	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
134	NC_012943	CAAG	2	8	5815	5822	50 %	0 %	25 %	25 %	253796920
135	NC_012943	AAG	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
136	NC_012943	CGCC	2	8	5911	5918	0 %	0 %	25 %	75 %	253796920
137	NC_012943	CAA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796920
138	NC_012943	CGA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
139	NC_012943	GTC	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796920
140	NC_012943	TGG	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
141	NC_012943	AGC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
142	NC_012943	GGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
143	NC_012943	GC	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	253796920
144	NC_012943	GGT	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
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147	NC_012943	GCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
148	NC_012943	CGGC	2	8	6726	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	253796920
149	NC_012943	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796920
150	NC_012943	GC	3	6	6812	6817	0 %	0 %	50 %	50 %	253796920
151	NC_012943	ATC	2	6	6854	6859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796920
152	NC_012943	ACG	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
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154	NC_012943	GTT	3	9	6979	6987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796920
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167	NC_012943	GAC	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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172	NC_012943	CGGT	2	8	7626	7633	0 %	25 %	50 %	25 %	253796921
173	NC_012943	ACC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796921
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175	NC_012943	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796921
176	NC_012943	CGA	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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194	NC_012943	GCT	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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210	NC_012943	TTC	2	6	9108	9113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796921
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219	NC_012943	CGA	2	6	9524	9529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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226	NC_012943	CGA	3	9	9707	9715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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230	NC_012943	CG	3	6	9848	9853	0 %	0 %	50 %	50 %	253796921
231	NC_012943	GAA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796921
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233	NC_012943	CAGAC	2	10	9901	9910	40 %	0 %	20 %	40 %	253796921
234	NC_012943	CGA	3	9	9932	9940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_012943	GAG	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_012943	CGC	2	6	10143	10148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796922
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240	NC_012943	CCG	4	12	10239	10250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796922
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243	NC_012943	CGCAA	2	10	10425	10434	40 %	0 %	20 %	40 %	253796922
244	NC_012943	GCC	2	6	10487	10492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796922
245	NC_012943	GCG	2	6	10500	10505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796922
246	NC_012943	CGGCG	2	10	10551	10560	0 %	0 %	60 %	40 %	253796922
247	NC_012943	TGT	3	9	10632	10640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796922
248	NC_012943	TTC	2	6	10652	10657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796922
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256	NC_012943	CGG	2	6	10894	10899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796922
257	NC_012943	TCG	2	6	10964	10969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_012943	TCC	2	6	11049	11054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_012943	ACG	2	6	11079	11084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_012943	GGC	2	6	11124	11129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_012943	TCG	2	6	11132	11137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_012943	CCT	2	6	11185	11190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_012943	ACCCG	2	10	11381	11390	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_012943	CGG	2	6	11422	11427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_012943	ACG	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_012943	ACC	2	6	11527	11532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_012943	ACC	3	9	11597	11605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_012943	GCC	2	6	11634	11639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_012943	GCAC	2	8	11710	11717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
270	NC_012943	CCG	2	6	11739	11744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_012943	CGA	2	6	11796	11801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_012943	ACT	2	6	11843	11848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_012943	CAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_012943	GAC	2	6	11965	11970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_012943	GGT	2	6	12004	12009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796923
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287	NC_012943	GCC	2	6	12417	12422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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289	NC_012943	GCCC	2	8	12555	12562	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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